Chuyến phiêu lưu của Ash và những người bạn lại bắt đầu. Lúc này tại Bắc cực, nhóm của tiến sĩ Lund đang nghiên cứu về loài hải cẩu. Trong lúc Tory đang chơi với lũ hải cẩu thì 1 thiên thạch lạ đâm vào gần đó, khiến cho lũ hải cẩu chạy tán loạn và làm Tory ngất đi. Yuko và Lund sau khi cứu Tory ra đã nhìn thấy bên trong thiên thạch là 1 con Deoxys. Con Deoxys ôm 1 viên pha lê màu lục và bắn lên trời 1 luồng cực quang. Sự tình cờ này có phải là điều may mắn với nhóm tiến sĩ? Những nguy hiểm nào đang chờ đợi họ ở phía trước?